Lasciato ormai alle spalle il periodo della sua iniziazione, Neo (l’Eletto) ora controlla alla perfezione i suoi poteri e continua ad entrare ed uscire da Matrix, insieme a Trinity, per combattere contro le forze della repressione. Nonostante il loro impegno, tuttavia, Zion (l’ultima roccaforte umana sulla terra) è assediata da un esercito di oltre 250.000 sentinelle pronte a dare l’assalto finale al genere umano. Nel frattempo, Neo consulta l’Oracolo, che gli riferisce di una scelta che presto l’Eletto dovrà fare.
