Il film racconta le vicissitudini del giovane Sean Anderson, studente prodigio ma inquieto. Da quando ha perso il padre, il suo scopo principale è mettere insieme quello che resta della sua famiglia, in particolare ritrovare il nonno, scomparso durante l’esplorazione di un’isola deserta. Il tutto nasce quando Sean, aiutato dal compagno della madre, riesce a decifrare un messaggio in codice che sembra provenire proprio dal nonno. L’isola descritta da Vernes, Stevensons e Swift nei loro libri esiste davvero…